要交的。农村合作社销售农作物是免增值税的（属于免交国税），因为增值税免交,所以城建税、教育费附加、地方教育费附加也免（即地税也免）。
同时销售农作物又免企业所得税，合作社还免印花税。不用交税。但是转为一般纳税人之后，一般纳税人的企业的纳税（增值税）税率为17%，凡是工业企业只要是在年销售收入额达到100万元以上，就要申报一般纳税人；商业企业营业收入过到180万元以上要申报一般纳税人。
在以上标准以下只能按小规模纳税人办理纳税，税率分别为6%和4%，一般纳税人的进项税可以进行抵扣，而小规模纳税人所发生的材料进项税则不可抵扣。
